Llamado a la transparencia de los modelos COVID-19

Hoy 1 de mayo de 2020 en la revista Science se publica una carta firmada por un número importante de científicos fundamentalmente de Estados Unidos y algunos otros de Europa titulada: Call for transparency of COVID-19 models. 

A partir de una traducción libre rescatamos los siguientes aspectos que consideramos de enorme relevancia para la comunidad científica: 

1) En el contexto actual es muy importante que los científicos de todo el mundo compartan sus conocimientos, experiencia, herramientas y tecnología.

2) Los modelos son herramientas fundamentales para anticipar, pronosticar y responder a todo tipo de crisis, incluidas las pandemias.

3) Los modelos son esenciales para conducir a los gobiernos regionales y nacionales en el diseño de políticas sanitarias, sociales y económicas para controlar la propagación de enfermedades y disminuir sus impactos.

Importante:
Presentar sólo los resultados de los modelos no es suficiente. Los científicos deben compartir abiertamente su código para que los resultados puedan ser evaluados y replicados.

Puntos por considerar en la evaluación de los modelos:
  • Supuestos
  • Parámetros
  • Algoritmos

Así la transparencia generará confianza pública y es la mejor defensa contra el malentendido y el uso mal intencionado de los propios modelos y sus resultados.

Las cajas negras patentadas y de código retenido por motivaciones competitivas no tienen cabida en la crisis global que enfrentamos hoy.

El artículo original puede leerse aquí

Taller de Análisis de Datos Espaciales. Sesión 4

Taller de Análisis de datos espaciales; esta vez con las siguientes funciones de GeoDa:
  • Mapas de co-localización
  • Mapa de riesgo atribuible
  • Mapa condicional
  • Cartograma
  • Video de mapa
Materiales del taller

Taller de Análisis de Datos Espaciales. Sesión 3

Taller de Análisis de Datos Espaciales 
Los temas abordados son: 
🔴 Marco Geoestadístico Nacional INEGI
🔴 Unión de Datos en QGIS
🔴 Filtros en QGIS
🔴 El Censo Económico INEGI
Descarga la presentación aquí

 

Casos SARS-CoV-2, abril 16, 2020

Una noción comúnmente utilizada en la demografía y el análisis de salud pública es el concepto de una tasa de mortalidad estandarizada (SMR), a veces también denominada riesgo relativo o riesgo excesivo.

Para este caso presentamos el número de casos confirmados de SARS-CoV-2 con respecto a la proyección de población total de CONAPO para cada municipio en 2020 en el que se registró al menos un caso.

En la evolución de la animación se puede observar el riesgo atribuible de menor a mayor para los municipios que presentan hasta el 16 de abril de 2020 al menos un caso conformado.



En esta animación se observa en orden ascendente los municipios con casos de SARS-CoV-2 al 16 de abril de 2020, se utilizó un método de clasificación Natural Breaks.




Software utilizado: GeoDa

Taller de Análisis de Datos Espaciales. Sesión 2


Compartimos la transmisión de la segunda sesión de nuestro Taller de Análisis de Datos Espaciales, los temas abordados son:
  • Unión de datos
  • Mapa de Cuantiles
  • Mapa Percentiles
  • Mapa de caja (Box Map)
  • Mapa de Desviación Estándar 

Materiales de la sesión

Lecturas recomendadas

Taller de Análisis de Datos Espaciales. Sesión 1

Compartimos la transmisión de nuestro Taller de Análisis de Datos Espaciales, los temas abordados son:
  • Índice de Moran Global. 
  • Indicadores Locales de Asociación Espacial (LISA)
  • Validación estadística del Índice de Moran
Descarga la presentación utilizada aquí.

Plugin HCMGIS

Este Plugin de QGIS permite descargar información en tiempo real del mapa de COVID-19 en tiempo real, entre muchas otras funciones. 


Funciones del Plugin HCMGIS
  • Mapa base: agregue docenas de mapas base globales de Google, Carto, ESRI, OSM Stamen, etc.
  • Batch Converter: convierte por lotes CSV a Point Shapefile, TXT / XLSX a CSV y otros formatos GIS en una carpeta y sus subcarpetas;
  • Descargue los datos de CO-VID19: Actualización en vivo global de COVID-19 y series temporales de Johns Holfkins CSSE, Actualización en vivo de Vietnam COVID-19 de HCMGIS OpenData;
  • Descargar OpenData: descargue datos abiertos de OSM Geofabrik, GADM, Open Development Mekong, HCMGIS OpenData; - Proyecciones Vn-2000: Busque el código EPSG para la proyección Vn-200 / TM3 para todas las provincias de Vietnam;
  • Procesamiento espacial: cree un esqueleto / eje medial / línea central para redes de carreteras / ríos y estructuras lineales similares, cree una línea central en los huecos del polígono (por ejemplo, bloques de construcción), encuentre el par de puntos más cercano / más alejado en un conjunto de puntos, combine capas (con el mismo tipo de geometría), capa dividida (basada en un campo único),
  • Cálculo de atributos: campos de datos de fusión / división, Conversor de fuentes vietnamita: Unicode <-> TCVN3 <-> Vni-Windows, MAYÚSCULAS, minúsculas.
Sitio web del plugin: https://hcmgis.vn/

Fuente: Repositorio del Plugin en QGIS: https://plugins.qgis.org/plugins/HCMGIS/